যুগ্ম প্রোটিনের অপ্রোটিন অংশ জৈব রাসায়নিক পদার্থ হলে তাকে বলা হয়—

যৌগিক প্রোটিনের অপ্রোটিন অংশ যদি জৈব রাসায়নিক পদার্থ হয়, তবে তাকে কো$-$এনজাইম (Coenzyme) বলা হয়। এনজাইমের সাথে যুক্ত এই জৈব অণুগুলি এনজাইমের কার্যকারিতা বাড়াতে সাহায্য করে। কো$-$ফ্যাক্টর হলো একটি বৃহত্তর শব্দ, যার মধ্যে কো$-$এনজাইম এবং অজৈব আয়ন দুটোই অন্তর্ভুক্ত। অ্যাক্টিভেটর হলো এমন পদার্থ যা এনজাইমের কার্যকারিতা বাড়ায়, কিন্তু এটি সরাসরি অপ্রোটিন অংশ নয়। অ্যাপো$-$এনজাইম হলো এনজাইমের প্রোটিন অংশ যা কো$-$ফ্যাক্টর বা কো$-$এনজাইম ছাড়া অকার্যকর থাকে।